EuroClonality-NDC

: UNIV8EC-NDC-096

: Univ8 Genomics

NGS panel, amely lehetővé teszi B- és T-sejtek klonalitásának, IG- és TCR-átrendeződéseinek, transzlokációinak és mutációinak kimutatását 82 génben a limfoproliferatív betegségek átfogó vizsgálatához.

Az EuroClonality-NDC egy célbefogáson alapuló technológián alapuló NGS-panel, amely lehetővé teszi a T- és B-sejtek klonalitásának, az IG- és TCR-átrendeződések, transzlokációk, CNV-k és SNV-k egyidejű kimutatását 82 limfoproliferatív betegségekkel kapcsolatos génben.

Így ez a teszt lehetővé teszi a limfoproliferatív betegségek összes releváns markerének első teljesen integrált elemzését, amelyeket jelenleg számos molekuláris tesztelési stratégia végez.

A B- és T-sejt-klónitás kimutatása a hagyományos PCR- és NGS-módszerekhez képest nagymértékben jobb és leegyszerűsödik a következő jellemzők kombinációjának köszönhetően:

Az IG és TR átrendeződések szekvenálással és CNV-kkel egyaránt kimutathatók
A rendszer minden típusú átrendeződést észlel, beleértve a nem funkcionális és a célközönséget is
A CNV-k, transzlokációk és mutációk kimutatása még erősen hipermutált szomatikus IG átrendeződésekkel járó (poszt)germinális centrum rosszindulatú daganatok esetén is hozzájárulhat a klonalitás meghatározásához.

Az eredmények kiértékelése az EuroClonality-NDC Analysis bioinformatikai folyamat segítségével lehetséges a BaseSpace Professional programban.

Az SNV és CNV elemzéshez használt gének listája: ABL1, ARID1A, ASXL1, ATM, BCL2, BIRC3, BRAF, BTG1, BTK, CARD11, CCND1, CCND3, CD79A, CD79B, CDKN2A, CDKN2B, CDKN2C, CKS1B, CREBBP, CXCR4, DIS3, DNMT3A, EGR2, EP300, ERG,
EZH2, FAT1, FBXW7, FOXO1, H1-2, H1-3, H1-4, H1-5, ID3, IDH1, IDH2, IKZF1, IL7R, IRF4, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KLF2, KMT2D, KRAS, MAP2K1, MAP3K14, MAPK1, MEF2B, MYC, MYD88, NFKBIE, NOTCH1, NOTCH2, NRAS, NT5C2, PAX5, PHF6,
PIK3CA, PLCG1, PLCG2, POT1, PTEN, PTPRD, RHOA, RUNX1, SAMHD1, SF3B1, SOCS1, STAT3, STAT5B, STAT6, TCF3, TENT5C, TET2, TNFAIP3, TP53, TRAF2, TRAF3, WT1, XPO1

További ellenőrzött régiók listája a CNV elemzéshez: chr9 - 9pTEL, chr9 - 9pCEN, chr11 - 11qCEN, chr11 - 11qTEL, chr13 - RB1, chr13 - 13qMDR, chr13 - 13qTEL, chr17 - 17pTEL

A transzlokációs elemzéshez felhasznált régiók listája: chr1 - STIL, chr2 - ALK, chr3 - BCL6, chr6 - DUSP22, chr8 - MYC, chr9 - CD274, chr9 - PDCD1LG2, chr11 - CCND1, chr11 - BIRC3, chr11 - KMT2A, chr18 - BCL2, chr19 - TCF3, chrX - CRLF2

diagnostika@pentagen.cz