EuroClonality-NDC

Kód produktu: UNIV8EC-NDC-096
Výrobce: Univ8 Genomics
NGS panel umožňující detekci klonality B a T buněk, IG a TCR přestaveb, translokací i mutací v 82 genech pro komplexní vyšetření lymfoproliferativních onemocnění.
Dokumenty ke stažení

Dokumenty ke stažení

Univ8_MSDS_EuroClonality-NDC_EN.pdf .pdf

Podrobnější informace o produktu

EuroClonality-NDC je NGS panel založený na target capture-based technologii, který umožňuje současnou detekci klonalit T- a B-buněk, IG a TCR přestavby, translokací, CNV a SNV u 82 genů asociovaných s lymfoproliferativními onemocněními.

Tím tento test umožňuje jako první provést plně integrovanou analýzu všech relevantních markerů lymfoproliferativních onemocnění, které jsou v současnosti prováděny řadou molekulárních testovacích strategií.

Detekce klonality B a T buněk je výrazně vylepšena a zjednodušena v porovnání s konvenčními metodami PCR a NGS díky kombinaci následujících vlastností:

  • Přeskupení IG a TR lze detekovat prostřednictvím sekvenování i CNV
  • Jsou detekovány všechny typy přeskupení, včetně nefunkčních a cross-target
  • Detekce CNV, translokací a mutací může přispět k určení klonality i v případě malignit (post) zárodečných center se silně hypermutovanými somatickými IG přestavbami

Vyhodnocení výsledků je možné pomocí bioinformatické pipeline EuroClonality-NDC Analysis v BaseSpace Professional.

Seznam zahrnutých genů pro SNV a CNV analýzu: ABL1, ARID1A, ASXL1, ATM, BCL2, BIRC3, BRAF, BTG1, BTK, CARD11, CCND1, CCND3, CD79A, CD79B, CDKN2A, CDKN2B, CDKN2C, CKS1B, CREBBP, CXCR4, DIS3, DNMT3A, EGR2, EP300, ERG,
EZH2, FAT1, FBXW7, FOXO1, H1-2, H1-3, H1-4, H1-5, ID3, IDH1, IDH2, IKZF1, IL7R, IRF4, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KLF2, KMT2D, KRAS, MAP2K1, MAP3K14, MAPK1, MEF2B, MYC, MYD88, NFKBIE, NOTCH1, NOTCH2, NRAS, NT5C2, PAX5, PHF6,
PIK3CA, PLCG1, PLCG2, POT1, PTEN, PTPRD, RHOA, RUNX1, SAMHD1, SF3B1, SOCS1, STAT3, STAT5B, STAT6, TCF3, TENT5C, TET2, TNFAIP3, TP53, TRAF2, TRAF3, WT1, XPO1

Seznam dalších zarhnutých oblasté pro CNV analýzu: chr9 - 9pTEL, chr9 - 9pCEN, chr11 - 11qCEN, chr11 - 11qTEL, chr13 - RB1, chr13 - 13qMDR, chr13 - 13qTEL, chr17 - 17pTEL

Seznam zahrnutých oblastí pro analýzu translokací: chr1 - STIL, chr2 - ALK, chr3 - BCL6, chr6 - DUSP22, chr8 - MYC, chr9 - CD274, chr9 - PDCD1LG2, chr11 - CCND1, chr11 - BIRC3, chr11 - KMT2A, chr18 - BCL2, chr19 - TCF3, chrX - CRLF2


Pro více informací, nás prosím, kontaktujte na e-mailu: diagnostika@pentagen.cz