- Produkty
- Reprodukce
- Molekulární diagnostika
- Kariéra
- O nás
- Kontakty
Sada xGen ssDNA & Low-Input DNA Library Prep Kit umožňuje přípravu knihoven z degradovaných a poškozených vzorků ssDNA a dsDNA v jediné reakci. Tato sada umožňuje uživatelům sekvenovat obtížně zpracovatelné vzorky pomocí jedinečné patentované technologie AdaptaseTM.
Adaptasová technologie vytváří molekuly knihoven z fragmentů jednořetězcové DNA, což umožňuje lepší obnovu komplexní vstupní DNA ze silně poškozených a degradovaných vzorků ve srovnání s jinými komerčně dostupnými produkty pro platformy Illumina®. Mezi typy vzorků patří degradovaná FFPE, stará DNA, chromatinová imunoprecipitace (ChIP) a další vzorky, které prošly poškozením DNA.
Souprava je určena pro uživatele, kteří potřebují sekvenovat vzorky obsahující ssDNA (silně poškozenou) nebo směsi ss a dsDNA. Patří sem mj. metagenomické a viromické vzorky, u nichž lze identifikovat relativní množství ssDNA i dsDNA fágů a virových genomů. Mezi další kompatibilní typy vzorků patří tepelně denaturované patogenní vzorky, vzorky extrahované za tvrdých denaturačních podmínek, aby se snížilo zkreslení extrakce, a vzorky tekuté biopsie související s onkologií, pokud je požadována detekce obsahu jednovláknové cfDNA.
Pracovní postup se skládá ze čtyř kroků:
Adaptázová technologie - Adaptázová reakce provádí současně tailing a ligaci R2 Stubby Adapteru na 3´ konce vysoce účinným způsobem nezávislým na templátu.
Extenze - extenční reakce vytváří druhé vlákno před ligací.
Ligace - ligační reakce přidává k původnímu vláknu R1 Stubby Adapter.
Indexovací PCR - PCR se používá k inkorporaci indexů vzorků a sekvencí potřebných pro sekvenování Illumina®. Indexovací primery jsou dodávány samostatně.
Pro více informací, nás prosím, kontaktujte na e-mailu: diagnostika@pentagen.cz