- Produkty
- Reprodukce
- Molekulární diagnostika
- Kariéra
- O nás
- Kontakty
Společnost IDT nabízí tvorbu xGen amplikonových panelů dle požadavků zákazníka.
Zakázkové amplikonové panely jsou dostupné v baleních po 384 reakcích.
Parametry zakázkových xGen amplikonových panelů:
| Parametry | Specifikace |
| Rozsah vstupní DNA | 10–25 ng amplikovatelné DNA |
| Velikost amplikonů | Různé velikosti v závislosti na požadovaném typu vzorku: plná krev, buněčná kultura, FFPE vzorky, cfDNA (běžně 150 bp) |
| Pokrytí navrhovaného designu | >90% požadovaných bází |
| Čas potřebný k přípravě | 2,5 hodiny od DNA po sekvenační knihovnu |
| Dodávané komponenty | Pool požadovaných primerů |
| Limit detekce | Pro varianty až 1% alelová frekvence |
| Rozsah velikosti panelu | Běžně 15–1500 amplikonů na panel |
| Možnosti multiplexingu | V závislosti na typu použitých indexních primerů |
| On-target % | >90% on-target čtení |
| Uniformita pokrytí | >80% uniformita pokrytí při průměrné hloubce >0.2 |
| Kompatibilní platformy | Illumina®; Oxford Nanopore Technologies™ |
Pracovní postup přípravy knihoven zakázkových xGen amplikonových panelů:
xGen Amplicon Panely mají pracovní postup v jedné zkumavce, který je hotový za pouhé 2 hodiny. Vytvoření NGS knihovny začíná multiplexní PCR reakcí. Váš zakázkový panel se zkombinuje se vzorkem DNA a dojde k amplifikaci cílových sekvencí. Vzorky se poté amplifikují pomocí indexovacích primerů, aby se vytvořila duálně indexovaná knihovna. Pro zpoolování více xGen knihoven lze použít xGen Normalase, pro zajištění optimální koncentrace výsledné sekvenační knihovny.
Pro více informací, nás prosím, kontaktujte na e-mailu: diagnostika@pentagen.cz