xGen™ Exome Hyb Panel | Zabýváme se dodávkou a distribucí výrobků pro laboratorní diagnostiku a IVF

Dokumenty ke stažení

idt_xgen-exome-research-panel-v2.pdf .pdf

Podrobnější informace o produktu

xGen™ Exome Hybridization Panel v2 pro celoexomové sekvenování, který umožňuje detekci variant v 19 435 genech. Panel pokrývá oblast 34 Mb lidského genomu a skládá se ze 415 115 individuálně syntetizovaných, 5' biotinylovaných oligonukleotidových sond.

vyráběn v souladu s ISO 13485 jako jedna velká šarže, což zajišťuje rovnost a konzistenci jednotlivých alikvotů
vysoké pokrytí genů RefSeq od konce ke konci i v oblastech s vysokým obsahem GC
navržen pomocí nového algoritmu zaměřeného na "on-target rating", tím je zajištěno hluboké a uniformní pokrytí cílových oblastí

Příprava knihovny je založena na hybridization capture technologii.

Produkt je dostupný v balení po 16 reakcích (10005152) a 96 reakcích (10005153).

Seznam zahrnutých genů na vyžádání.

Doporučujeme používat panel v kombinaci s vyhodnocením pomocí platformy SeqOne, která poskytuje robustní, škálovatelné a intuitivní řešení pro analýzu a interpretaci dat z WES.

On-target pokrytí a uniformita panelu xGen™ Exome Hybridization Panel v2:

Obrázek 1. Pracovní postup pro celoexomové sekvenování od IDT má vysoké procento "on-target" v porovnání s alternativními dodavateli. Sekvenované knihovny byly připraveny pomocí enzymatického štěpení a přípravě knihovny založené na ligaci podle protokolů pro přípravu knihoven od každého dodavatele. Knihovny byly zachyceny a multiplexovány podle protokolu pro exome capture panel každého výrobce (X-8, R-8, and A-8, kde “8” značí 8-plex captures, n=2). Pro IDT uvádíme 1-plex (n=3) a 12-plex (n=2) captures (IDT-1, resp. IDT-12). Obohacené knihovny byly sekvenovány na přístroji NextSeq® (Illumina) v režimu "high output" s použitím 2 x 100 bp párových čtení pro analýzu. On-target báze byly stanoveny pomocí Picard (procento vybraných bází) s použitím 5 Gb na knihovnu.

Maximální počet vzorků na flowcell:

Obrázek 2. xGen Exome Hyb Panel v2 může zvýšit počet vzorků nanesených na flowcell. DNA knihovny byly připraveny ze 100 ng lidské genomové DNA (Coriell) a obohacené buď jako 8-plex, n=1 (dodavatel R), 8-plex, n=2 (dodavatelé X a A) nebo 12-plex, n=2 (IDT) captures. Obohacené knihovny byly sekvenovány (2 x 100 bp) na přístroji NextSeq® (Illumina) a byl odhadnut počet čtení potřebných k dosažení 75x průměrného cílového pokrytí (Picard) na vzorek a počet vzorků, které by se vešly na NovaSeq™ S2 flowcell (Illumina).

Pro více informací, nás prosím, kontaktujte na e-mailu: diagnostika@pentagen.cz