CleanPlex® ready-to-use panely

Kód produktu: -
Výrobce: Paragon Genomics, Inc.
NGS panely založené na amplikonovém sekvenování a patentované CleanPlex technologii
Dokumenty ke stažení

Dokumenty ke stažení

cleanplex_DNA_amplicon_sequencing_workflow.png .png

Podrobnější informace o produktu

NGS panely pro detekci variant v somatických i germinálních vzorcích pomocí patentované CleanPlex® technologie.

CleanPlex® technologie se vyznačuje pokročilým patentovaným algoritmem pro návrh primerů multiplexní PCR, výjimečně uniformní amplifikační chemií multiplexní PCR a inovativní patentovanou chemií pro přečištění.

 

  • Vysoká uniformita amplifikace a nízký šum pozadí PCR pro přesné vyhledávání variant
  • Pracovní postup lze dokončit za pouhé 3 hodiny s minimem času pro manuální práci a snadnou automatizaci
  • Kompatibilní se širokou škálou vstupních vzorků včetně složitých (př. degradovaná FFPE DNA, DNA z odpadních vod)
  • Nízké vstupní množství a vysoká citlivost (detekce variant s vysokou spolehlivostí u náročných vzorků a vzorků s nízkým vstupním množstvím)
  • Vynikající škálovatelnost velikosti panelu od několika až po více než 20 000 amplikonů v jednom multiplexním PCR souboru
  • Kompatibilní s hlavními sekvenačními platformami (Illumina, Ion Torrent, MGI DNBSeq, Element Biosciences, Oxford Nanopore, etc.)
  • Detekce jednonukleotidových variant (SNV), malých inzercí a delecí (Indels), variací počtu kopií (CNV), genových fúzí / sestřihových variant, úrovně genové exprese, nádorové mutační zátěže (TMB), mikrosatelitní nestability (MSI), vnitřní tandemové duplikace (ITD) atd.

 

Aktuálně dostupné "ready-to-use" panely pro nádorová onemocnění:

916001, 916002,
916103

8, 96, 384 reakcí

CleanPlex OncoZoom Cancer Hotspot Panel

2900+ hotspotů 65 onkogenů a tumor supresorových genů

916073, 916074,
916075

6, 96, 384 reakcí

CleanPlex Tumor Mutational Burden 500 Gene Panel

516 genů spojených s hlavními typy solidních nádorů, hodnocení mutační zátěže nádorů

916112, 916113

8, 96 reakcí

CleanPlex BRCA1 & BRCA2 Panel

všechny exonové reagiony s 20 bp přesahem do intronových sekvencí genů BRCA1 a BRCA2

916114, 916115

8, 96 reakcí

CleanPlex Hereditary Cancer Panel

37 genů, 2 hotspot mutace v 3' UTR genu BRCA1 a Bolandova inverze v genu MSH2

930017, 930015, 930013

8, 96, 384 reakcí

CleanPlex Comprehensive Hereditary Cancer Panel

germinální varianty nebo mutace v 88 genech spojených s hereditárními nádorovými syndromy

916008, 916104, 916105, 916009, 916106

8, 16, 48, 96, 384 reakcí

CleanPlex TP53 Panel

všechny exonové regiony s 20bp přesahem do intronových sekvencí genu TP53

 

Paragon Genomics také nabízí další predesignované panely a CleanPlex panely na míru založené na CleanPlex Technologii společně s nástrojem ParagonDesigner. Bližší informace k těmto produktům naleznete na stránkách výrobce.


Pro více informací, nás prosím, kontaktujte na e-mailu: diagnostika@pentagen.cz